אוסף מוזיאון טיקוטין לאמנות יפנית הוא מבין הגדולים והחשובים שנמצאים מחוץ ליפן.

האוסף כולל כשבעת אלפים מוצגי אמנות ואומנות מתוכם כארבעת אלפים מאוספו של פליקס טיקוטין: מאתיים ציורים, אלף חמש מאות הדפסים, אלף שלוש מאות רישומים, עשרה מסכים מצוירים, שמונה מאות פריטי טקסטיל, שלוש מאות ספרים עתיקים מעוטרים, מאה וארבעים כלי קרמיקה, תשע מאות פריטי נטסקה (netsuke), מאתיים עבודות לכה, שלושים ושבע חרבות עתיקות ושש מאות ותשעים אביזרי חרבות וחפצי אמנות שימושית בעיקר מהמאות

ה־19-17, וכן כארבע מאות הדפסים יפניים מודרניים. במהלך השנים גדל אוסף המוזיאון. נוספו לו תרומות של אוספים אחרים כגון אוסף לואיס ב. גוטמן ואוסף דניאל והילדה לבוב מניו יורק, אוסף אברהם הורודיש מאמסטרדם ואוסף שולמית ודוד רובינפיין מקליפורניה.

כמו־כן, נתרמו למוזיאון יצירות אמנות רבות על ידי: יוג'י אבה מגלריה יוסיידו בטוקיו, יוהנה בורנשטיין־טיקוטין מאמסטרדם, פול בלום מטוקיו, אליס גרילי מטוקיו, אילנה דרוקר־טיקוטין מירושלים, פליקס יודה מלוס אנג'לס, ג'. מאיויאמה מטוקיו, מיצוקו מצומורה מקיבוץ דליה, ברנרד וסואה פאקר מגלריה פאקר בבוסטון, היינץ מ. קאמפר מהאג, פרנק קורן מטוקיו, הארי שופק מהונולולו, גלריה ריו הבינלאומית מטוקיו, ועוד.

רוב האוסף נבנה מתרומות. מוזיאון טיקוטין לאמנות יפנית ישמח לקבל יצירות חדשות של אמנות מסורתית, של אמנות עכשווית וצילום.